優質的番茄種子，應該具有高抗病，高產。菜農在選擇的時候要根據季節，栽培種植方式，市場需求等來挑選。合格的番茄種子其種子凈度應高于98%，種子色澤純正、無霉變，純度高于95%，發芽率高于88%，水分含量低于8%，為此選購種子應到信譽較高的科研單位或種子部門購種，嚴防購得假冒劣種子造成經濟損失。

    另外，番茄種子儲存的時候也要注意，要使種子充分干燥。一般番茄種子的壽命3～6年，在生產上利用年限2～3年。